为建立高白鲑肌肉蛋白质双向电泳分析方法，通过固相pH梯度胶条等电聚焦和SDS-PAGE垂直电泳对蛋白质进行分离，分别考察了蛋白质样品制备方法、上样量、IPG胶条pH值、等电聚焦程序、助凝剂剂量、SDS-PAGE凝胶浓度及染色方法等影响的因素。结果显示，采用丙酮沉淀法制备蛋白质样品，上样量90 μg，IPG胶条pH值5~8，一向胶聚焦时间400 V 16 h+1 000 V 2 h，平衡时间15 min，0.05 mL过硫酸铵及2 μL TEMED，10%（体积分数）二向分离胶和硝酸银染色时，获得蛋白质分离效果好，分辨率高及横纹少的高白鲑肌肉蛋白质二维电泳图谱，为高白鲑肌肉蛋白质组学的进一步研究奠定了基础。